آزمون میکروبی مجموعه‌ای از روش‌های علمی و آزمایشگاهی است که برای شناسایی، شمارش و ارزیابی میکروارگانیسم‌ها در مواد و محصولات مختلف به‌کار می‌رود. این میکروارگانیسم‌ها شامل باکتری‌ها، قارچ‌ها، مخمرها، ویروس‌ها و مایکوپلاسما هستند. انجام آزمون میکروبی یکی از پایه‌های اصلی کنترل کیفیت در صنایع دارویی، تجهیزات پزشکی، آرایشی‌بهداشتی، غذایی و محیط‌های کنترل‌شده محسوب می‌شود.

هدف اصلی آزمون میکروبی، اطمینان از ایمنی محصول و پیشگیری از انتقال آلودگی‌های میکروبی به مصرف‌کننده است. نتایج آزمون میکروبی نشان می‌دهد که آیا محصول یا محیط تولید، در محدوده قابل‌قبول از نظر آلودگی میکروبی قرار دارد یا خیر. به همین دلیل، آزمون میکروبی به‌عنوان یکی از الزامات کلیدی در چارچوب استانداردهای بین‌المللی مانند GMP، ISO 13485، ISO 11737، USP و EP تعریف شده است.